למרות שבעת פתיחת אתר המשתמש בוחר תבנית מעוצבת שכוללת את הגדרת כל צבעי האתר הרי שניתן לשנות צבעים באתר ככל העולה על הדעת ולפי הטעם האישי.
יש חשיבות רבה בבחירת צבעים לאתר. צבעים הם חלק משפה והם חלק מאמירה מובהקת. הדוגמא הקלאסית היא שצבעים ורודים מיוחסים לבנות ואף יותר מכך- לתינוקות. ואילו גווני תכלת מיוחסים לתינוקות ממין זכר.
כמו כן, העין מעדיפה שילובי צבעים שנוח לה איתם. שילובי צבעים בלתי הרמוניים מייצרים רתיעה או הסתייגות, לעיתים בלתי מודעת.
לכן חשוב מאד להתאים את צבעי האתר לשפה ולמסר הכללים שבהם מדבר האתר.
ניתן לשנות צבעים לאתר- רקע פנימי, רקע חיצוני, צבע גופן ועוד
"עיצוב האתר" >> "רקעי וצבעי האתר" >>"רקע חיצוני" ו"רקע פנימי"
מספר כלים חינמיים (!!!) להתאמת צבעים ולבחירת צבעים לאתרים:
אתר צבעים מדהים: http://kuler.adobe.com/
האתר נותן פלטות של צבעים. אפשר גם לבצע חיפוש לפי נושא האתר שלכם וכך לקבל הצעות בהתאם. אפשרות נוספת היא להעלות קובץ של תמונה או לוגו של האתר ואתר הצבעים ייתן לכם פלטת צבעים מומלצת.